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构建高校协同创新中心，作为我国新时期建设创新型国家的重要组织形式，虽然是在改革开放以来高校大学科技企业、大学科技园等传统产学研结合大学科技创新组织模式基础上发展和提出来的，但它作为旨在突破体制机制壁垒的开放式创新的组织形式，同传统产学研结合相比较，无论在合作的形式，还是内容机制等方面都有较大的不同。构建高校协同创新中心，要借鉴传统产学研合作的经验教训和新时期新型研发组织的成功做法，关键是要确立科学明晰的功能定位，实行理事会领导下的中心主任负责制，建立符合科技发展规律的运行机制。