【摘 要】
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试验通过高通量测序技术,测定放牧藏猪、舍饲藏猪与瘦肉型猪(杜×长×大,DLY猪)结肠微生物16S rRNA V3-V4区域的基因序列,比较分析西藏高原3个类型猪结肠微生物的组成及多样
【机 构】
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西藏农牧学院高原生态研究所,西藏林芝860000;西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000;西藏农牧学院食品科学学院,西藏林芝860000;西藏农牧学院动物科学学院,西藏林芝860000
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试验通过高通量测序技术,测定放牧藏猪、舍饲藏猪与瘦肉型猪(杜×长×大,DLY猪)结肠微生物16S rRNA V3-V4区域的基因序列,比较分析西藏高原3个类型猪结肠微生物的组成及多样性.结果 显示,放牧藏猪和舍饲藏猪结肠微生物分类操作单元(OTU)总数、辛普森指数、Chao1指数、ACE指数及香农指数显著高于DLY猪(P＜0.05),放牧藏猪与舍饲藏猪无显著差异(P＞0.05).3个类型猪结肠微生物共划分为14个门,59个属.厚壁菌门在所有猪中相对丰度均最高,放牧藏猪放线菌门相对丰度显著高于舍饲藏猪与DLY猪(P＜0.05),舍饲藏猪拟杆菌门相对丰度显著高于放牧藏猪与DLY猪(P＜0.05).放牧藏猪双歧杆菌属、Dehalobacterium、萨特氏菌属、YR C22的相对丰度显著高于舍饲藏猪与DLY猪(P＜0.05),舍饲藏猪瘤胃球菌属、Sphaerochaeta、Paludibacter相对丰度最高(P＜0.05).结果 表明,放牧藏猪结肠中含有较多与纤维降解和抗病力有关的菌群.
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