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在根管治疗中，根管内消毒、防治感染是关键步骤之一，有研究报导证明，厌氧菌、尤其是专性厌氧菌是感染根管内的主要细菌。这些含酶活性较高的厌氧菌及其代谢产物，和感染的牙本质碎屑，在根管预备过程中被推出根尖孔，或由于冲洗时压力过大等因素激惹了根尖周组织，从而导致炎症介质、各种缓激肽、组胺、前列腺素等炎性物质增加，同时，感染根管内的细菌及其产物具有抗原特性，甚至根管治疗药物如甲醛甲酚本身都有可能又成为半抗原，引起变态反应。