【摘 要】
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目的分析银川市2016-2017年手足口病(HFMD)CVA16亚型的序列特征及分子流行病学特征,为银川市HFMD的防治提供科学依据。方法使用qPCR技术,检测2016-2017年银川市哨点医院送检
【机 构】
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银川市疾病预防控制中心病原微生物检验科; 宁夏医科大学总医院生物芯片国家工程研究中心宁夏分中心; 宁夏医科大学总医院(宁夏医科大学临床医学院);
【基金项目】
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自治区卫生计生委重点研究课题(2016-NW-073);宁夏高等学校一流学科建设(宁夏医科大学国内一流学科临床学院)资助项目(No.NXYLXK2017A05)
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目的分析银川市2016-2017年手足口病(HFMD)CVA16亚型的序列特征及分子流行病学特征,为银川市HFMD的防治提供科学依据。方法使用qPCR技术,检测2016-2017年银川市哨点医院送检的880份疑似标本,进行肠道病毒通用型和CVA16型核酸检测。随机选取每年5份CVA16标本,分离病毒,扩增VP1区基因片段病测序,对CVA16型的同源性进行分析,并构建系统进化树进行基因进化分析。结果 880份疑似标本中,阳性率为79.5%(700/880),其中CVA16阳性率为21.0%(147/880),2016年CVA16阳性率为40.3%(124/308);2017年CVA16阳性率为5.9%(23/392)。2016-2017年CVA16亚型发病高峰集中在2016年7月-12月,占全年CVA16阳性总数的86.3%(107例/124例),CVA16在2016年为优势亚型,而在2017为劣势亚型(P<0.01)。进化分析显示,10株CVA16与原型株(CVA16-G10-1951)核苷酸序列同源性为75.9%～80.1%,10株间同源性为95.2%～99.7%,均集中于B2亚型进化分支,与中国大陆近年来CVA16流行的基因型一致。与同时期国内广东、福建、南京、云南等地的毒株序列亲缘关系较近,处于同1分支。结论银川市HFMD CVA16亚型流行年龄集中于<5岁儿童,流行时间分布特征明显。2016-2017年银川市CVA16毒株未出现独立进化,而是与国内其他省份处于1个共循环状态。
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