【摘 要】
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[目的]分析荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063中A82846B合成的代谢途径和关键基因.[方法]使用Illumina二代测序和PacBio三代测序技术对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行全基因组测序,利用Glimmer预测编码序列,使用HPLC和LCMS鉴定次级代谢产物,使用antiSMASH 5.0软件预测次级代谢产物合成基因簇.利用Geneious软件对A82846B合成相关基因进行分析,对其中的mbt类基因着重分析.[结果]本实验菌株鉴定为荒漠拟孢囊菌(Kibdelosporangi
【机 构】
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西南大学药学院,重庆400715;西南大学生物技术中心,重庆400715
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[目的]分析荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063中A82846B合成的代谢途径和关键基因.[方法]使用Illumina二代测序和PacBio三代测序技术对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行全基因组测序,利用Glimmer预测编码序列,使用HPLC和LCMS鉴定次级代谢产物,使用antiSMASH 5.0软件预测次级代谢产物合成基因簇.利用Geneious软件对A82846B合成相关基因进行分析,对其中的mbt类基因着重分析.[结果]本实验菌株鉴定为荒漠拟孢囊菌(Kibdelosporangium aridum),基因组中有一条线性染色体,无质粒,序列全长12475688 bp,GC含量为66.27％,有11900个开放阅读框,共有47个基因簇.该菌株具有合成A82846B的能力,且生物合成相关基因位于Cluster32,包含33个基因,mbtH类基因gene07864的过表达促进A82846的合成,提升了26.42％,卤化酶基因为gene07859,与万古霉素、巴利霉素的卤化酶相似度较高.[结论]本研究对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行了基因组序列分析,获得了A82846B生物合成相关的功能基因信息,为A82846B的代谢途径和工程改造提供了强有力的基础.
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