目的:研究比较肛周脓肿切开引流术与根治术的临床应用与效果.方法:纳入我院2017年3月至2018年12月期间收治的肛周脓肿患者126例为研究对象,根据患者住院编号随机分为研究组(63例)及参照组(63例),研究组患者开展肛周脓肿根治术,参照组患者开展肛周脓肿切开引流术,对两组患者收治治疗效果及临床治疗进行尽心分析比较.结果:研究组患者手术治疗总有效率显著优于参照组(P＜0.05);研究组患者围术期肛瘘的发生率为4.76%,参照组为33.33%,研究组患者肛瘘的发生率显著低于参照组(P＜0.05),;研究组患者临床治疗期间切口愈合时间及感染控制时间均显著短于参照组(P＜0.05).结论:相较于切开引流术,对肛周脓肿患者开展根治术治疗的效果更为显著,同时能够有效降低肛瘘的发生风险,能够有效提高切口愈合效率及感染控制效率,值得在诊疗中开展推广.