【摘 要】
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目的 使用生物信息学分析非小细胞肺癌(NSCLC)血浆外泌体miRNA差异表达情况,寻找可作为NSCLC生物标志物的miRNA.方法 从GEO数据库寻找符合要求的芯片数据集,分析在NSCLC血浆
【机 构】
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苏州市立医院呼吸与危重症科,江苏苏州 215001
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目的 使用生物信息学分析非小细胞肺癌(NSCLC)血浆外泌体miRNA差异表达情况,寻找可作为NSCLC生物标志物的miRNA.方法 从GEO数据库寻找符合要求的芯片数据集,分析在NSCLC血浆外泌体中异常表达的miRNA.利用TCGA数据库对筛选出的miRNA进行生存分析,确认其生物标记物潜力.使用数据库对筛选出的miRNA进行靶基因预测及功能预测.结果 从GSE114711数据集,筛选出差异表达最明显的miR-141,生存分析表明miR-141能够影响NSCLC患者的生存.利用TarBase,TargetScan和microT-CDS对miR-141进行靶基因预测,得到59个靶基因,对它们进行功能分析发现,它们可能影响肿瘤细胞的迁移和侵袭、增殖和凋亡等.结论 利用生物信息学发现,miR-141在早期NSCLC患者血浆外泌体中异常表达,通过调控靶基因,影响多项生理生化功能,不利于患者生存,可成为早期NSCLC的生物标志物.
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