【摘 要】
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参考NCBI GenBank中上传的雪貂、海獭DQA基因序列设计出RT-PCR扩增引物,克隆了美洲水貂DQA基因全长cDNA序列;利用生物信息学软件构建了DQA基因系统进化树,预测了DQA蛋白结构与功能。结果表明:DQA基因全长cDNA序列大小为1 147 bp, ORF序列为768 bp,编码255个氨基酸,存在23个氨基酸的信号肽序列;DQA蛋白第236位氨基酸疏水性最强,53位氨基酸亲水性最强,218-240氨基酸可能为跨膜区域;蛋白质二级结构存在3个α-螺旋区和14个β-折叠区,处于无规则卷曲状态
【机 构】
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菏泽学院病原微生物及新型防治药物研发重点实验室,中国农业科学院特产研究所/吉林省省部共建特种经济动物分子生物学国家重点实验室
【基金项目】
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山东省自然基金面上项目(ZR2019MC036),山东省高等学校科技计划一般项目(J17KA126),国家大学生创新训练项目(201710455151)。
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参考NCBI GenBank中上传的雪貂、海獭DQA基因序列设计出RT-PCR扩增引物,克隆了美洲水貂DQA基因全长cDNA序列;利用生物信息学软件构建了DQA基因系统进化树,预测了DQA蛋白结构与功能。结果表明:DQA基因全长cDNA序列大小为1 147 bp, ORF序列为768 bp,编码255个氨基酸,存在23个氨基酸的信号肽序列;DQA蛋白第236位氨基酸疏水性最强,53位氨基酸亲水性最强,218-240氨基酸可能为跨膜区域;蛋白质二级结构存在3个α-螺旋区和14个β-折叠区,处于无规则卷曲状态
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