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毕业论文（设计）是高校教学的重要实践环节，是独立学院本科合格评估的重要指标，不能轻言取消；分析食品科学与工程专业本科毕业论文（设计）存在的问题，针对此，我们通过构建毕业论文（设计）创新团队模式，从团队选题模式、团队组建模式、团队管理模式、团队创新模式、团队考核模式等五方面探讨，建立符合学科和时代发展的本科毕业环节教学新模式，为高校更深入地进行教学改革提供一定借鉴作用。