短尾负鼠microRNA前体的计算鉴定与分析

来源 :生命科学研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户：tinnagirl

【摘要】

：

目前，关于microRNA（miRNA）的研究越来越多，但是有关负鼠miRNA的研究却相对较少-为了研究灰色短尾负鼠（Monodelphisdomestica）的miRNA，以人和小鼠的miRNA为参考序列，分别利用BLAST、比

【作者】

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姜毅罗野婯刘沅郑新娟孙远东袁志栋

【机构】

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湖南科技大学生命科学学院

【出处】

：

生命科学研究

【发表日期】

：

2013年4期

【关键词】

：

MIRNA BLAST 比较基因组学短尾负鼠 miRNA BLAST comparative genomics Opossum

【基金项目】

：

国家自然科学基金青年项目（31100914）,湖南省普通高等学校教学改革研究项目（教育厅批准号220）,湖南科技大学博士启动基金资助项目（E51178）

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目前，关于microRNA（miRNA）的研究越来越多，但是有关负鼠miRNA的研究却相对较少-为了研究灰色短尾负鼠（Monodelphisdomestica）的miRNA，以人和小鼠的miRNA为参考序列，分别利用BLAST、比较基因组学两种方法获得可能的短尾负鼠前体序列pre-miRNA），并各自用机器学习方法分类鉴定-取这两个结果的交集即得到54条新的短尾负鼠pre-miRNA-将这些新发现的pre-miRNA与miRBase19中已经报道的156条pre—miRNA序列合并，设置miRNA基因间距

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