奶牛CSF3基因遗传多态性筛查及其生物信息学分析

来源 :浙江农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wsmkt

【摘要】

：

为探究奶牛集落刺激因子3(CSF3)基因的遗传免疫功能,采用DNA混合池扩增后用直接测序法对奶牛CSF3基因的5个外显子进行单核苷酸多态性(SNP)位点筛选,并采用生物信息学方法对CS

【作者】

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吴佳陈朗姜涛黄国明李倬李耀东张丽刘丽霞

【机构】

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西北民族大学生命科学与工程学院

【出处】

：

浙江农业学报

【发表日期】

：

2020年6期

【关键词】

：

奶牛 CSF3 SNP 生物信息学分析 dairy cowCSF3SNPbioinformatics analysis

【基金项目】

：

西北民族大学中央高校基本科研业务费资金(31920190025,31920200074),西北民族大学本科生科研创新项目(XBMU-BYL19127),西北民族大学引进人才科研项目(xbmuyjrc201413)

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为探究奶牛集落刺激因子3(CSF3)基因的遗传免疫功能,采用DNA混合池扩增后用直接测序法对奶牛CSF3基因的5个外显子进行单核苷酸多态性(SNP)位点筛选,并采用生物信息学方法对CSF3基因开放阅读框(ORF)区、编码蛋白质信号肽跨膜区、氨基酸理化性质、蛋白质亲/疏水性、mRNA二级结构、蛋白质二级和三级结构进行预测分析。结果显示,奶牛CSF3基因外显子2上存在3个SNP位点,分别为T66C、C67A、C118A,全部为错义突变,分别导致丝氨酸(Ser)、脯氨酸(Pro)变为组氨酸(His)。mRNA二

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