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利用稻瘟病菌的一段倒位重复序列Pot-2设计的一对引物直接对稻瘟病菌的DNA进行PCR扩增.根据带型相似性大于80%为度可将国际水稻所一个稻瘟病圃上的310个菌株划分6个宗亲群(lineage).这些依分子标记划分的宗亲群与品种的遗传背景有密切关系,而且各宗亲群在水稻不同生育期有不同的波动方式.