11种热带植物EST-SSR标记的开发和多样性分析

来源 :热带作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：auiadufzxyw

【摘要】

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对11种热带植物的640 863条表达序列标签（ESTs）进行分析,发掘出13 916个EST-SSR位点,平均分布频率约为109.37个/Mb,主要特点表现为：（1）不同物种间的EST-SSR丰度存在明显差异,其中

【作者】

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黄启星左娇孔华郭运玲周霞郭安平

【机构】

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中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

【出处】

：

热带作物学报

【发表日期】

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2012年7期

【关键词】

：

热带植物 EST SSR 微卫星 Tropical plants EST SSR Microsatellite

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对11种热带植物的640 863条表达序列标签（ESTs）进行分析,发掘出13 916个EST-SSR位点,平均分布频率约为109.37个/Mb,主要特点表现为：（1）不同物种间的EST-SSR丰度存在明显差异,其中菠萝EST-SSR位点最为丰富（201.75个/Mb）;芒果EST-SSR位点丰度最低（49.55个/Mb）;（2）二、三核苷酸基元的SSR最为常见,两者占总数的88.68%。其中,AG/CT、AT/AT和AAG/CTT在不同基因组区域都是占优势的SSR类型;（3）SSR在基因组不同区域分布丰

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