【摘 要】
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花瓣衰老是观赏园艺植物具有经济价值的重要性状。为了解文心兰衰老花瓣的转录组学特征,挖掘参与调控文心兰花瓣衰老的关键基因,本研究对盛开期(E)、衰老初期(F)和衰老期(G)的文心兰切花花瓣进行RNA测序。测序序列经组装拼接后,共获得48 661个Unigenes,在NR、NT、Swissport、KEGG、COG、interpro、GO数据库中分别注释到34 922 (71.77%)、26 286
【机 构】
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海南大学热带作物学院海南省热带生物资源可持续利用重点实验室
【基金项目】
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海南省基础与应用基础研究计划(自然科学领域)高层次人才项目(2019RC147); 海南省重点研发计划项目(ZDYF2020053); 五指山市科技和工业信息化局项目(WZSKTPXM2021005); 国家自然科学基金项目(31560573)共同资助;
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花瓣衰老是观赏园艺植物具有经济价值的重要性状。为了解文心兰衰老花瓣的转录组学特征,挖掘参与调控文心兰花瓣衰老的关键基因,本研究对盛开期(E)、衰老初期(F)和衰老期(G)的文心兰切花花瓣进行RNA测序。测序序列经组装拼接后,共获得48 661个Unigenes,在NR、NT、Swissport、KEGG、COG、interpro、GO数据库中分别注释到34 922 (71.77%)、26 286 (54.02%)、23 134 (47.54%)、25 678 (52.77%)、14 483 (29.76%)、25 580 (52.57%)和9 103 (18.70%)条Unigenes。经表达量比较,在盛开期(E)和衰老初期(F)之间获得差异表达基因3 914条,衰老初期(F)和衰老期(G)之间获得差异表达基因1 579条。经GO功能富集分析,花瓣盛开期(E)和衰老初期(F)共有3 914、衰老初期(F)和衰老期(G)之间1579条差异表达基因被注释参与生物学过程、细胞组分和分子功能三个功能组。KEGG功能富集分析表明,盛开期(E)和衰老初期(F)之间的差异表达基因参与18个代谢通路,而衰老初期(F)和衰老期(G)之间的差异表达基因参与7个代谢通路。鉴定出可能在文心兰花花瓣衰老发挥关键作用的一批包括乙烯、生长素、赤霉素、茉莉酸、脱落酸及细胞分裂素在内的植物生长调节物质的合成与信号转导相关基因和转录因子基因。本研究所获得的文心兰花瓣衰老转录组数据,为进一步鉴定衰老相关基因的功能,了解花瓣衰老分子机制打下基础。
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