洋山深水港海域表层海水中古菌多样性特点

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【摘要】

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利用DGGE、定量PCR以及16S rRNA基因克隆文库技术对洋山深水港海域表层海水中的古菌多样性组成进行了调查和分析.通过Quantity One软件分析不同样品的DGGE图谱,发现洋山深水

【作者】

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孙国伟肖劲洲陈小兵王洪明龚超文潘迎捷王永杰

【机构】

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上海海洋大学食品学院,上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心,农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室（上海）

【出处】

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微生物学杂志

【发表日期】

：

2014年5期

【关键词】

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洋山深水港表层海水 16S RRNA基因古菌多样性 Yangshan deep-water port surface seawater 16S rRN

【基金项目】

：

国家自然科学基金（41376135）,上海高校特聘教授东方学者岗位计划基金（20101222）,上海市人才发展基金（2011010）,上海市科委工程中心建设（11DZ2280300）

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利用DGGE、定量PCR以及16S rRNA基因克隆文库技术对洋山深水港海域表层海水中的古菌多样性组成进行了调查和分析.通过Quantity One软件分析不同样品的DGGE图谱,发现洋山深水港3个不同海域（小洋山港口区、大洋山港口区、中间航道）的古菌群落多样性组成不存在明显的区别;利用定量PCR的方法对3个不同样品中的古菌16S rRNA基因拷贝进行计数,发现3个不同海域的古菌16S rRNA基因拷贝数的数量关系为：大洋山海域（（1.69±0.19）×106 copies/mL）＜中

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