茶树EST资源中SSR的信息分析

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从NCBI公共数据库下载获得1989条茶树EST,去除其中的低质量的和冗余的序列,得到全长为734.54kb的1589条无冗余EST。共在这些序列中发掘出了281个EST.SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%。这些EST-SSR的平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61 kb。茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。本研究为茶树EST-SSR标记的建立和进一步应用奠定了基础。
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