杨树同义密码子用法的初步分析

来源 :植物生理与分子生物学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zzqeng
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摘要:杨树是世界上广泛栽培的重要造林树种之一,已经成为林木基因工程研究的模式植物。用杨树的314个蛋白编码基因,通过对应分析和ENc-plot分析探讨了若干重要因子对杨树密码子用法的效应。从分析结果中可以看出,在影响最大的第一条向量轴上,基因的坐标位置与该基因的表达水平(CAI)极显著负相关(r=-0.94″),其次是与GC3s和基因长度极显著相关(r=0.86″和仁一0.57″),说明基因表达水平高低是影响密码子发挥作用的主要因素,基因编码区碱基组成和基因长度次之。ENc-plot分析结果也证明了这一点
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