土壤微生物群落与植物群落间的作用机制是探究生物地球化学循环过程和维持植被生态系统稳定的关键。黑河上游植被的垂直分布特征明显，选取垫状植被（CV）、灌丛草甸（HM）、森林草原（FS）、山地干草原（MS）和荒漠草原（DG）共5种典型植被样地，运用高通量测序技术分析冬、夏季不同植被类型土壤细菌的群落结构和多样性，基于FAPROTAX数据库进行群落功能预测，运用冗余分析、结构方程模型探讨驱动土壤细菌群落的主要环境因子，并揭示细菌群落变化的作用机制与季节差异。结果表明：①不同植被类型和季节下土壤理化性质差异显著，各指标随深度的变化规律不同，森林草原（FS）的土壤含水量和碳氮养分含量更高；②细菌群落α-多样性指数在季节间的差异（P＜0.05）大于植被类型（P＞0.05），冬季群落丰度整体高于夏季，物种多样性在冬季随海拔呈“倒U”型分布，夏季呈“W”型分布；③细菌群落结构和组成在门水平上无显著差异，优势种群为酸杆菌门（Acidobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）和放线菌门（Actinobacteria），但在属水平上随季节有明显不同；④土壤细菌群落的功能随植被类型和季节变化较小，均以化能异养、硝化和氨氧化作用为主；⑤影响细菌群落的关键因子存在季节差异，冬季为土壤温度（ST）、总有机碳（TOC）和pH，夏季为土壤含水量（SWC）、碳氮比（C/N）和pH；⑥土壤细菌群落受彼此关联的环境因子的协同作用，土壤理化性质对细菌群落多样性和功能的影响较植被类型更直接，改善土壤的碳、氮水平有助于提升细菌的物质和功能多样性。研究结果可为探索区域植被退化机制和维持高寒生态系统稳定提供参考。