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税收是市场经济条件下政府调节产业结构的重要手段之一。税收对产业结构的调节作用，是通过相对减少投资者的利润以减少投资或相对增加投资者的利润以促进投资来实现的。但不同税种的调节效果不一样。流转税调节产业结构在短期内很有效，长期使用则会导致逆向调节，而所得税的调节效果较好。我国应建立以所得税为主并与流转税等税收相互配合形成合力的税收政策以促进产业结构的优化升级。