【摘 要】
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目的 分别比较4例HNSCC患者癌和癌旁组织的环状RNA、微小RNA和mRNA芯片表达谱,构建hsa_circRNA_103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15相关的ceRNA网络,探讨其表达趋势.方法 利用芯片筛选HNSCC组织中差异表达的circRNA、miRNA和mRNA基因,根据miRwalk3.0在线软件预测的结果,构建HNSCC中的circRNA/miRNA/mRNA-相关的ceRNA网络.采用qRT-PCR方法检测HNSCC组织中hsa_circRNA_103580/hsa-miR
【机 构】
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中国医科大学附属口腔医院院内感染管理办公室,辽宁沈阳,110002;中国医科大学附属口腔医院口腔颌面外科,辽宁沈阳,110002
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目的 分别比较4例HNSCC患者癌和癌旁组织的环状RNA、微小RNA和mRNA芯片表达谱,构建hsa_circRNA_103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15相关的ceRNA网络,探讨其表达趋势.方法 利用芯片筛选HNSCC组织中差异表达的circRNA、miRNA和mRNA基因,根据miRwalk3.0在线软件预测的结果,构建HNSCC中的circRNA/miRNA/mRNA-相关的ceRNA网络.采用qRT-PCR方法检测HNSCC组织中hsa_circRNA_103580/hsa-miR-9-5P/PRDM15基因的表达.结果 芯片技术检测4例HNSCC患者癌和癌旁组织中差异表达的circRNA、miRNA及mRNA基因,获得显著差异的环状RNAs转录本311个,microRNAs转录本52个及circRNA433个.结合以上数据,构建了一个包含48种circRNAs,21种miRNAs和79种mRNAs的ceRNA网络并验证has-circRNA_103580、has-miR-9-5p与PRDM15的基因表达水平与芯片中表达趋势一致.结论 hsa_circRNA_103580/hsa-miR-9-5P/PRDM 15轴可能是HNSCC预后和治疗新的靶点.
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