【摘 要】
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[目的]探索苹果热激转录因子(Heat shock transcription factor,Hsf)家族的生物学信息与功能.[方法]在苹果基因组GD-DH13 v1.1中检索找到36个Hsf家族成员,并通过Pfam和NCBI Conserved Domain Database进行确认,然后利用TBtools、ExPASy、MEME等软件对其中33个含有完整Hsf结构域的基因做了进一步分析.[结果]这些Hsf基因编码的蛋白质含有189~ 530个氨基酸,分子量为21703.71~58972.96,等电点为
【机 构】
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滨州学院学报编辑部,山东滨州256603;滨州学院山东省黄河三角洲生态环境重点实验室,山东滨州256603
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[目的]探索苹果热激转录因子(Heat shock transcription factor,Hsf)家族的生物学信息与功能.[方法]在苹果基因组GD-DH13 v1.1中检索找到36个Hsf家族成员,并通过Pfam和NCBI Conserved Domain Database进行确认,然后利用TBtools、ExPASy、MEME等软件对其中33个含有完整Hsf结构域的基因做了进一步分析.[结果]这些Hsf基因编码的蛋白质含有189~ 530个氨基酸,分子量为21703.71~58972.96,等电点为4.55~ 8.58.亚细胞定位预测显示,除MD00G1095900和MD02G1171800可能定位于叶绿体/细胞核中,MD05 G1313700可能定位于细胞核/线粒体中,其他Hsf均定位于细胞核中.染色体定位和共线性分析显示苹果Hsf基因没有串联重复,但有16对共24个苹果Hsf基因存在片段重复.在盐碱胁迫下,多数Hsf基因的表达显著下调.蛋白相互作用分析显示MD03G1258300与热休克蛋白、超氧化物歧化酶铜分子伴侣、蛋白磷酸酶2C、蔗糖非发酵-1-相关蛋白激酶γ调节亚基存在相互作用;MD15G1283700与热休克蛋白、IAA氨基酸水解酶、碱性亮氨酸拉链存在相互作用.[结论]苹果Hsf家族成员可能在调控盐碱胁迫响应中发挥重要作用,该研究为进一步研究苹果Hsf的生物功能提供一定理论参考.
其他文献
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[目的]明确不同根系分隔方式对间作玉米大豆根际红壤Hedley磷组分与作物磷吸收的影响,为理解间作模式下红壤磷高效利用机制提供理论依据.[方法]以玉米大豆间作为研究对象开展盆栽模拟试验,设置根系塑料分隔(SB)、尼龙网分隔(MB)和不分隔(NB)3种方式,研究在不同磷水平下(P2O5,0、50、100、150、200 mg/kg土,分别用P0、P1、P2、P3、P4表示)玉米和大豆生物量、磷吸收量及根际土壤活性、中活性和稳定性磷组分的变化.[结果]相比SB,NB显著提高间作玉米和大豆的生物量,间作系统生物
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