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一个简单的基于碱基对堆砌的热力学计算方法确定茄子斑纹病毒RNA3′末端假结结构的稳定性。RNA分子内可能的碱基配对区域形成的自由能可以通过计算△G释放值和需要值的综合求得。作为计算自由能的一个例子是EMV RNA3′末端假结结构,如果它有不同的结构形式。且其自由能值分别为△G=-115.5kJ/mol和-65.7kJ/mol,那么,前者是比较可能的存在形式。