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ISSR(inter simple sequeence repeat)技术是建立在PCR基础上的一种分子标记技术，自1994年建立以来，已广泛应用于生物遗传多样性及品种鉴定研究，并作为构建遗传图谱的工具。其优点在于：不需要事先知道靶序列；由于较高的退火温度和更长的引物序列，可产生重复性好的扩增带：模板需要量少，多态性丰富，结果记录方便。ISSR—PCR体系的专属性比较强，不同种植物甚至不同的引物。其反应体系有一定差异，只有在最佳条件下，才能获得稳定清晰的多态性条带。