1株快速增殖的HAV分离株基因型分析

来源 :传染病信息 | 被引量 : 0次 | 上传用户：aqcnbbz1

【摘要】

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目的确定1株快速增殖HAV临床分离株HAV302的基因型及其特点。方法提取培养病毒RNA模板,通过反转录-聚合酶链反应技术扩增该病毒编码区基因并行序列测定,随后利用序列分析软件

【作者】

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白冰珂胡燕邬顺全姜棋予杨瑞创柴燕涛李瑞生侯俊

【机构】

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解放军第三○二医院实验技术研究保障中心

【出处】

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传染病信息

【发表日期】

：

2015年3期

【关键词】

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序列分析甲型肝炎病毒基因型 sequence analysis hepatitis A virus genotype

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目的确定1株快速增殖HAV临床分离株HAV302的基因型及其特点。方法提取培养病毒RNA模板,通过反转录-聚合酶链反应技术扩增该病毒编码区基因并行序列测定,随后利用序列分析软件对其进行序列分析和基因型比对。结果 HAV302株VP1/2A区基因序列与Gen Bank中收录的HAVⅠ型中的ⅠB亚型MBB株核苷酸同源性最高（99.4%）。进化树分析显示,HAV302株与MBB株亲缘最近。与MBB株相比,非结构蛋白编码区中的2B和2C区在整个病毒的编码区中变异最大。结论 HAV302株属于HAVⅠ型中的ⅠB亚型

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