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ＲＡＰＤ是新发展起来的一种分子标记，近几年在植物遗传育种中得到广泛应用。ＲＡＰＤ分析需要分离高质量的核ＤＮＡ，棉花叶片中多酚类化合物含量高，在ＤＮＡ分离过程中，它们跟核酸、蛋白质发生不可逆反应，从而影响了ＤＮＡ的得率和纯度。我们利用最初提取液中增加甘露糖来阻止多酚化合物跟核ＤＮＡ的共价结合，结果得到了高纯度的ＤＮＡ，该ＤＮＡ适于棉花ＲＭＤ分析，并探索出了棉花ＲＡＰＤ分析的反应适宜条件。