用全基因组关联分析筛选甘蓝型油菜叶片叶绿素含量候选基因

来源 :作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yetigai
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
提高油菜产量是保障国家粮油安全的重要举措.作物“源”“流”“库”理论表明,充足的光合产物(源)是高产的前提,而叶绿素是直接参与光合作用的物质,因此,选育高叶绿素含量的甘蓝型油菜是提高产量的重要途径.本课题组前期对全球收集的588份优异油菜种质资源进行5X重测序,获得385,692个高质量SNP标记.利用SPAD-502叶绿素仪于2018—2019连续2年测定苗期完全伸展的叶片叶绿素总量,结合获得的SNP标记进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),筛选与叶绿素含量显著关联的SNP位点.结果表明,2018年鉴定到5个显著关联的SNP位点,贡献率为5.51%~7.89%,其中S6_3493805位点贡献率最大;2019年检测到46个SNP位点,贡献率为7.29%~10.34%,其中S13_11413088位点贡献率最大.将显著关联SNP位点上下游各500 kb区间内的基因与参考基因组比对,初步筛选出2022个油菜基因.将其基因序列在拟南芥基因组内进行BLAST比对,结合前人已报道的拟南芥同源基因功能,筛选到23个候选基因,其中5个属于叶绿素合成途径同源基因.本研究结果为后续油菜叶片叶绿素含量的遗传改良奠定了基础.
其他文献
电感耦合等离子发射光谱法是一项先进的测试技术,在铜、锌、砷、镉、锡、锑、钨、铅和铋等元素的测试中应用较为广泛,可为金属矿床的深部找矿工作提供技术支撑.本文以4件土壤
近年来,由于民用航空的迅速发展以及民营航空公司进入市场,引发飞行员流动加速,引起了政府及社会各界的广泛关注和强烈反响。飞行员作为稀缺资源,是航空公司赖以生存的基础,流动问
2015年以前,乐视网信息技术(北京)股份有限公司快速发展,乐视网采用的业务扩张模式是配合乐视整体的产业链垂直化建设。乐视网作为互联网软件与服务行业总市值最高的领军企业踏上