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目的:探讨基于科研绩效考核建立学科分层管理模式的可行性和效果。方法:以笔者所在的高校附属医院为研究对象，以科研绩效为依据，将全院科室评分由高至低依次评为领军学科、优势学科、骨干学科和潜力学科。以动态考核的方式评价学科发展。结果:全院共有41个科室，按照既定的科研绩效考核标准，确定了5个领军学科、9个优势学科、20个骨干学科和7个潜力学科。经过2年的建设，获批国家级项目200多项，中标科研经费近2亿元，获得国家级和省部级科技成果奖30项，专利授权213项，发表SCI论文千余篇，重大重点项目数量不断提升，各学科建设均取得了一定的成效。结论:实施学科分层科研绩效考核，对各科室的科研工作和人才培养工作有积极推动作用。