【摘 要】
：
目的:应用高通量测序技术检测无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级实验小鼠肠道的菌群组成,分析其细菌携带状况.方法:应用高通量测序技术,对14个品系共65只SPF级实验
【机 构】
：
上海交通大学医学院附属瑞金医院 检验系,上海,200025;上海实验动物研究中心 上海市实验动物质量监督检验站,上海,201203;上海交通大学医学院附属瑞金医院 临床微生物科,上海,200025;
论文部分内容阅读
目的:应用高通量测序技术检测无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级实验小鼠肠道的菌群组成,分析其细菌携带状况.方法:应用高通量测序技术,对14个品系共65只SPF级实验小鼠的回盲部肠道内容物样本中细菌16S rRNA V3～V4区进行深度测序,分析样本的菌群组成、丰度和Alpha多样性,并在属水平上筛选葡萄球菌属、假单胞菌属、支原体和棒状杆菌属.结果:65只SPF级健康成年小鼠的肠道内容物样本经数据过滤和质控后,共得到144318条高质量序列用于后续分析,结果提示相同品系样品间菌群丰度表现出明显的差异.所有样本的序列主要集中在以下8个门,依次为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、放线菌门(Actinobacteria)、Saccharibacteria、软壁菌门(Tenericutes)和螺旋菌门(Spirochaetae).在属水平上检测到了葡萄球菌属、假单胞菌属、支原体和棒状杆菌属.结论:相同品系的SPF级实验小鼠肠道菌群在物种组成、丰度及Alpha多样性方面也会表现出显著差异,有必要致力于研究各种方法以使实验动物的肠道菌群在可控和可监测范围内,高通量测序技术提供了这一可能.
其他文献
目的:研制一款应用于眼战伤冲洗结膜囊的装置,以在一线抢救时预防并发症的发生.方法:冲洗装置采用流量、压力控制的技术形式,由冲洗开关、冲洗液管、加压腔体、加压手柄、压
前列腺癌(PC)是发生在前列腺上皮组织的恶性肿瘤,也是男性泌尿生殖系统最常见、病死率最高的恶性肿瘤.前列腺肿瘤进展缓慢,早期不易发觉,未转移前,可有效诊疗和控制,一旦快速
19080年1月,《医疗卫生装备》的前身《野战卫生装备资料》呱呱落地,诞生之初以半年刊形式在军内发行.1985年,更名为《军队卫生装备》,并改为季刊.
自2019年12月开始,新型冠状病毒(世界卫生组织将其命名为 2019 novel coronavirus,2019-nCoV)感染机体引起的肺炎首先在武汉暴发,此后,全国各地多处有报告新病例.
自2019年12月以来,全国暴发了乙类传染病新型冠状病毒肺炎(以下简称新冠肺炎),发病地区以武汉为主.2020年2月11日,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)在日内瓦召开
目的:观察分析新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)肺炎(新冠肺炎)患者的CT表现,探讨CT在诊断中的价值.方法:回顾性收集2020年1月20日至2月10日在上海交通大学医
目的:探究狼疮抗凝物检测中稀释蝰蛇毒时间(diluted Russell viper venom time,dRVVT)法与混合试验(Rosner指数)检测结果间的相关性及方法学特点.方法:2015年9月至2019年9月
目的:探讨6个遗传性凝血因子Ⅹ(factor Ⅹ,FⅩ)缺陷症家系的分子发病机制,并采用凝血酶生成试验(thrombin generation test,TGT)评估FⅩ缺陷症患者的出血风险.方法:收集6例先
特发性基底节钙化又被称为Fahr病,随着该病致病基因被发现,且其受累脑区其实并不局限于基底节,故也被称 为 原 发 性 家 族 性 脑 钙 化 症(primary familial brain calcific