基于胃癌基因表达谱的肿瘤分化程度标志基因的鉴定

来源 :中华检验医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zibzibzib
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 通过胃癌差异基因表达谱提供的信息鉴定用于识别胃癌分化程度的分子标志物.方法 从本实验室前期所建立的胃癌Oligo基因芯片数据库中选取15份胃癌全基因组表达谱芯片数据,包括9份低分化胃癌和6份高分化胃癌标本数据,采用生物信息学分析方法BAGEL和k-TSP筛选配对的分类器,用于识别肿瘤的分化程度.随后采用ROC曲线对所筛选的特征分子标志物的分类敏感度和特异度进行判断,鉴定具有最强分类能力的分类器.选取北京肿瘤医院30份胃癌组织标本,包括22份低分化胃癌和8份高分化胃癌标本,采用实时荧光定量PCR对所鉴定的分类器进行验证.结果 利用胃癌分化差异基因表达谱数据,采用BAGEL分析方法筛选出了121个表达变化大于2倍的差异表达基因(FC>2.0,P<0.001),并在此基础上进一步采用k-TSP分析方法获得了3组用于区分胃癌高低分化程度的胃癌特征基因,包括MYLIP和TMPRSS3,ZNF266和TM4SF1以及SNAI2和CNFN.ROC曲线结果显示,SNAI2和CNFN组合基因对胃癌标本的分化程度进行判断具有最高的分类敏感度(100%)和特异度(100%),其AUC达到1,其他两组分类器则分别为0.981和0.963.实时荧光定量PCR结果显示,在22份低分化胃癌标本中,18份标本(82%)的SNAI2的表达水平高于CNFN;在8份高分化胃癌标本中,6份标本(75%)的SNAI2的表达水平低于CNFN.结论 SNAI2和CNFN在不同分化程度胃癌中具有特定的表达模式,并且两者的表达水平呈现负相关趋势,提示SNAI2和CNFN组合可能作为判断胃癌分化程度的分子标志物.
其他文献
本文阐述了一级公路穿集镇段标准横断面如何优化设计,从而减少穿集镇段老路两侧的拆迁,解决道路两侧车辆行人出行问题以及过往车辆正常安全行驶。
人们生活质量及生活水平的不断提高,出行范围及频率响应增加,对公路项目建设施工质量的要求越来越高。我国公路工程的造价管理和控制,是关系着整个公路建设项目的重要控制手段,是
对慢性盐度胁迫对许氏平(鱼由)(Sebastes schlegeli)鳃、头肾、脾脏超微结构的影响进行了研究.研究表明:经盐度为5的低盐胁迫30d后,鳃氯细胞顶端小窝较浅,胞质内微细小管系统
描述了中国木兰科木兰属一新种--红花玉兰(Magnolia wufengensis L. Y. Ma et L. R. Wang),并绘了模式图.本种的主要特点是:落叶乔木,花被片9,近相等,整个花被片内外为均匀的
铁路路基质量对铁路运行的安全造成一定的影响,本文在论述了铁路路基的基本技术要求,进而阐述了如何对其进行防护。
目的比较免疫球蛋白超家族黏附分子在淋巴管、大血管和微血管内皮细胞的表达特点,探讨免疫球蛋白超家族黏附分子在淋巴管内皮细胞表达的意义.方法从狗的胸导管、颈总动脉、颈
随着我国经济科技的发展,交通事业得到不但进步。在交通建设中工程质量受到了人们的高度关注,而工地试验室是工程施工管理以及监理的重要组成部分,在整个施工质量中担负着重要的
在当今社会,我国的经济快速发展,同时我国的公共设施建设力度也随之快速发展,特别是对于公共道路的建设。因此,要想使得我国道路安全系数有所提高,就必须要严格控制公路试验检测质
现代社会,煤炭作为主要的能源,其生产的情况就将会直接影响到国家的经济发展和人们的日常生活。经济的发展带动对矿产资源的需求量也日益增大,对矿产的开采和生产的技术要求也越
铁路企业文化对铁路职工、企业和社会的影响是深远的,成功的铁路企业无一不是思想政治工作的先进单位。深化对铁路企业文化和思想政治工作内涵的理解和认识,找准两者辩证关系,把