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县级疾病预防控制机构是国家、省市级专业疾控机构的基层网脚，也是下级非专业疾病控制机构(乡镇卫生院)的业务指导站，在我国的疾病预防控制体系中发挥着重要的枢纽作用。然而现阶段县级疾病预防控制机构由于各种投入不足，运行体制不顺，因而举步维艰，难于正常履行政府赋予的业务管理和技术服务职能。在突发公共卫生事件应急反应、疫情监测、疫情处理、信息管理等诸多方面都难以适应。作为基层疾病控制专业机构的管理者，提出几点意见供同仁参考。