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目的
阐明云南省2006—2015年118株狂犬病病毒(Rabies virus, RABV)核蛋白(Nucleoprotein, N)基因进化特征及流行病学特点。
方法在云南省狂犬病流行区采集狂犬、可疑犬和病牛脑组织以及狂犬病病例脑组织、唾液和脑脊液标本，用直接免疫荧光法进行病毒抗原检测，阳性标本提取病毒核酸，通过RT-PCR扩增RABV的N基因序列并进行序列测定，用MEGA5.0软件邻接法(Neighbor-Joining)进行系统进化分析。
结果经RT-PCR和序列测定获得2012—2015年云南省91株RABV的N基因序列，并与2006—2011年获得的云南27株RABV及邻省和东南亚地区的29株RABV的N基因序列进行系统进化分析。结果表明，云南RABV进化群可分为YN-A(105株)、YN-B(6株)和YN-C(7株)，并分别属于中国进化群中的China-I、China-VI和China-II。YN-A流行株在2006—2015年间每年均有分布，其中，2006—2011年14株，2012—2015年91株，并分布于13个州(市)；YN-B和YN-C分别仅分布于2006—2010年和2008—2011年，地区分布也较为局限。YN-A和YN-C与相邻四川、贵州、广西和湖南省的China-I或China-II进化群流行株亲缘关系较近，YN-B与缅甸、泰国、越南和柬埔寨流行株亲缘关系较近。
结论云南省RABV存在不同传播来源的3个进化群。YN-A为优势进化群，在2006—2015年间广泛分布于云南省狂犬病流行区，并具有较强的传播速率。2012年以来云南省未再发现YN-B和YN-C进化群的流行。