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为了从母系遗传角度阐明普洱毛脚乌鸡与南涧绿耳乌鸡的遗传差异,本研究采用PCR产物直接测序法对随机采集的48只普洱毛脚乌鸡和48只南涧绿耳乌鸡的mtDNA控制区第Ⅰ高变区序列进行了群体变异检测并对获得的数据进行了群体遗传和系统发育分析.在普洱毛脚乌鸡中检测到24个核苷酸多态位点,共定义了12种单倍型,单倍型多样度为0.829±0.039,群体内遗传距离为0.016±0.003.在南涧绿耳乌鸡中共检测到28个核苷酸多态位点,共定义了13种单倍型,单倍型多样度为0.907±0.01