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目的
筛选可能受甲基化调控的，与髓母细胞瘤(medulloblastoma，MB)WNT分子亚型相关的微小RNA(miRNA)分子标志物。
方法采用NanoString技术对45例原发性MB石蜡样本进行了包含22个经典MB亚型特异性基因的mRNA表达水平的检测，从而对肿瘤进行分子亚型鉴定。同时通过miRNA表达芯片检测去甲基化药物处理前后MB细胞系(Daoy、D283、D341)的miRNA表达情况，筛选出可能受甲基化调控的miRNA分子标志物，并用甲基化特异性PCR(MSP)和即时荧光定量PCR方法对其甲基化状态和表达水平分别进行验证。最后，对照分子亚型找到与MB亚型相关的受甲基化调控的miRNA。
结果45例MB除1例无法准确划分亚型外，其余44例中4例为WNT组，8例为SHH组，16例为Group3，16例为Group4。miR－449a在去甲基化药物处理前后的MB细胞系中表达水平具有明显差异，生物信息学分析确认了其启动子区CpG岛的存在，MSP方法进一步证明了部分肿瘤受启动子高甲基化的调控，且WNT亚型MB肿瘤样本中发现miR－449a存在相对高表达。
结论基于金标准(NanoString技术)对MB肿瘤进行分子亚型鉴定，并发现miR－449a在MB细胞系中受到甲基化调控，其可能为WNT亚型MB的分子标志物。