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科技创新是推动区域经济发展的关键。黄河三角洲作为国家战略重点发展的高效生态经济区，其科技创新能力与半岛蓝色经济区和山东省的平均水平相比还存在一定的差距。借鉴珠三角地区和长三角地区提高科技创新能力的经验，应加快建设适合该区域特点的区域创新体系；通过建设高教科研中心，提高科技的原始创新能力和集成创新能力；支持鼓励企业自主创新，推动企业成为技术创新主体；加强工业领域、农业领域和海洋领域的科学技术合作研究和技术成果的引进推广，全面提高该区域的科技创新能力。