猪δ冠状病毒SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用

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猪δ冠状病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)是一种新的引起仔猪腹泻的冠状病毒,2014年以来在我国各省开始流行,建立一种快速、准确的检测方法对于该病流行病学、致病机制的研究具有重要的意义。根据GenBank中公布的PDCoV M基因序列设计一对特异性引物,扩增M基因的特异性片段,构建pMD18-T-PDCoV-M重组质粒,以此为模板,SYBR Premix Ex Taq为荧光染料,通过对荧光定量RT-PCR(reverse transcription-PCR)扩增条件的优化,建立了针对PDCoV的荧光定量RT-PCR检测方法,并对所建立方法的特异性、灵敏性和稳定性进行了研究。结果显示,所建立的方法具有高度敏感性,最低检测限为54拷贝/μL;应用该方法对猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus of swine,TGEV)、猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)和猪繁殖与呼吸综合症病毒(Porcine respiratory and reproductive syndrome virus,PRRSV)等其他常见猪病毒性病原检测均为阴性,表明所建立的方法具有较好的特异性;且具有较好的重复性,组内和组间变异系数均小于1%。对临床198份腹泻样品进行检测,阳性率为20.71%(41/198)。实验所建立的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法能快速、准确检测新发PDCoV,为该病的深入研究提供了新的技术手段。
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