水稻、拟南芥组织特异性启动子的序列特征分析

来源 :中国农学通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：runzhong

【摘要】

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基因转录是遗传信息传递和表达的枢纽,确定转录因子与靶基因间的调控关系以及转录因子在靶基因上的结合位点成为理解转录调控机制的核心问题。分析UniGene数据库获得的拟南芥

【作者】

：

姜志磊李淑芳胡庆才龙丽坤

【机构】

：

吉林省农业科学院农业生物技术研究所

【出处】

：

中国农学通报

【发表日期】

：

2013年15期

【关键词】

：

拟南芥水稻基因表达序列标签顺式作用元件启动子 Arabidopsis rice EST cis-acting element promoter

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基因转录是遗传信息传递和表达的枢纽,确定转录因子与靶基因间的调控关系以及转录因子在靶基因上的结合位点成为理解转录调控机制的核心问题。分析UniGene数据库获得的拟南芥和水稻中根、叶片、花、种子4种组织中特异表达基因和组织中特异不表达基因。从TAIR和RAP-DB获得其启动子序列。利用生物信息学软件MEME预测获得组织特异表达基因的顺式作用元件。利用模式搜索软件FIMO,考察顺式作用元件序列的分布特征。发现了9个组织特异表达基因的顺式作用元件,其中＂CCACACA＂达到极显著水平。本研究技术和策略可为基因

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