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对绿色食品产品结构动态变化进行科学分析是产品结构调整与优化的重要前提。应用灰色关联理论计算2000～2008年我国绿色食品产业内产品间的灰色关联度，对绿色食品产品结构及其灰色动态关联变化规律进行分析，进而通过方差分析和σ-收敛性判定我国绿色食品产品结构变化显著。实证研究结果为提高产品加工度和附加值，增加禽畜水产类产品生产等产品结构调整措施，为促进绿色食品产业的结构优化与效率提高提供了决策依据。