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以早丰和燕明2个板栗品种为试材，应用编号为ISSR52的引物，对ISSR反应体系中的dNTPs、TaqDNA聚合酶、引物、模板和甲酰胺等主要影响因子进行了优化筛选。结果表明：20μLISSR反应体系各组分的最适浓度分别为1×Buffer（含2．0mmol／L的Mg^2＋），dNTPs0．2mmol／L，TaqDNA聚合酶1．0U，引物0．2μmol／L，模板25ng。加入2．0％的甲酰胺有利于减轻背景的干扰。利用该体系对9个河北省板栗品种（系）和1个山东省板栗品种进行了分析，以明确河北省板栗居群