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红花沟金矿为含金硫化物石英脉型金矿床,主要容矿构造是NNW—SN和NNE—NE向构造裂隙,直接近矿围岩为斜长角闪岩和闪长玢岩.与钾长石化交代重熔花岗岩空间分布关系密切.岩石化学、微量元素、稀土元素及Pb、Sr、S、C、O、H同位素地球化学研究表明,成矿物质可能源于基底太古宇绿岩建造,主要为含透辉斜长角闪岩及其重熔产物,而与中生代花岗岩、火山岩无明显的物质来源联系.为与太古宇绿岩建造有关的交代重熔岩浆热液成因,成矿具同源性,继承性和多期叠加之特征.