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对甜槠Castanopsis eyrei进行遗传多样性研究的过程中，为了获得清晰可靠、重复性强的ISSR扩增结果，利用正交设计对Mg^2＋，dNTP，引物，Taq酶，牛血清蛋白（BSA）和模板DNA等6种因素5个水平进行筛选和优化。确定甜槠ISSR-PCR最适宜反应体系为：10μL反应体积中，1×Taq酶配套缓冲液（10mmol·L^-1 Tris-HCl，pH 9．0，50mmol·L^-1 KCl，10g·L^-1 TritonX-100），1．7mmol