加权基因共表达网络识别子宫内膜癌中与肿瘤干细胞干性相关的基因

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目的 鉴定与子宫内膜癌(Uterine Corpus Endometrial Carcinoma,UCEC)中肿瘤干细胞干性相关的枢纽基因.方法 子宫内膜癌的转录组测序数据和临床信息均在公共数据库癌症基因图谱(TCGA)中获取.基于转录组测序数据分析mRNA表达的肿瘤干细胞指数(mRNAsi)及表观遗传调控的肿瘤干细胞指数(EREG-mRNAsi),分析其与UCEC病理分级的相关性.通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选模块关键基因.通过模块关键基因编码的蛋白质互作网络筛选枢纽基因,并对其进行功能注释和信号通路富集分析.结果 UCEC肿瘤组各样本的mRNAsi值与UCEC病理分级及患者年龄(以65岁为界)成正相关(P<0.001);WGCNA筛选出10个枢纽基因,GO和KEGG分析提示枢纽基因富集于细胞周期调控,有丝分裂及DNA同源重组修复等通路.结论 本研究得到10个与UCEC肿瘤干细胞干性特征相关的枢纽基因可能对UCEC的发生相关.
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