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有充分的证据支持线粒体和叶绿体起源的内共生假说，即：紫色细菌、α－类群的成员是线粒体的祖先，而蓝细菌的成员是叶绿体的祖先。这一证据来自分子伴娘６０蛋白基础的系统发育学分析，并且与１６Ｓ ｒＲＮＡ序列为基础的分析结果是完全一致的，这一结果产明，嗜碱芽胞杆菌Ｃ－１２５菌株在系统发育地位上更接近枯草芽孢杆菌。