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居延汉简中记载了诸多病案资料，学者多认为是伤寒之类的疾病。但细读汉简，并结合现今居延地区流行疾病的情况，推断居延汉简中所记载的许多伤寒病例应是鼠疫。针对当地的高发病率，上至汉代中央政府，下至居延各级屯戍组织，都非常重视屯军中的疾病防治工作。居延边塞通过有效的疾病防治制度，遏制了传染病的蔓延，保障了戍边吏卒的身体健康，对于稳定军心，维护屯戍军队的战斗力，发挥了积极作用。