【摘 要】
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目的 通过生物信息学分析,筛选高糖诱导的阴茎海绵体内皮细胞损伤关键差异基因,预测糖尿病性勃起功能障碍(DED)的潜在治疗靶点.方法 在GEO(Gene Eexpression Omnibus)数据库
【机 构】
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广西壮族自治区南宁市广西中医药大学研究生学院 广西南宁 530200;广东省广州市中山大学附属第三医院不育与性医学科 广东广州 510631;广西壮族自治区南宁市广西中医药大学附属瑞康医院男性科 广西
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目的 通过生物信息学分析,筛选高糖诱导的阴茎海绵体内皮细胞损伤关键差异基因,预测糖尿病性勃起功能障碍(DED)的潜在治疗靶点.方法 在GEO(Gene Eexpression Omnibus)数据库中下载高糖环境下阴茎海绵体内皮细胞损伤的芯片表达谱(GSE146078),利用GPL17021平台初步筛选正常对照组和高糖致内皮细胞损伤组的差异基因,采用STRING进行蛋白质与蛋白质相互作用网络验证,利用Cytoscape的Hub插件分析Hub核心基因,使用R软件对差异基因进行GO功能注释,使用DAVID数据库KEGG通路富集分析.结果 共筛选到367个差异表达基因,其中包含有150个上调基因,217个下调基因.核心差异基因包括上调表达基因Ccl19、Cxcl1、IL-6、Zscan4家族、GSTA家族、CYP2D家族及Saa家族成员和下调表达基因Cxcl12、Sox9.其中血清淀粉样蛋白A(Serum amyloid A,Saa)家族成员Saa1、Saa2、Saa3均显著上调表达,并与Lcn2、Orm2、Pon1及Apoa1等多个载脂蛋白或脂相关蛋白有关联.GO分析发现Saa家族主要与胆固醇代谢、脂解反应,脂蛋白代谢等过程相关.KEGG分析发现Saa家族主要参与PPAR信号通路以及胆固醇代谢.结论 Saa家族成员在高糖处理的小鼠阴茎海绵体内皮细胞中呈高表达状态,并与脂蛋白代谢等过程相关.因此我们推测Saa家族可能通过载脂或脂相关蛋白参与DED的发生和发展过程,但具体作用有待进一步的功能验证.
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