【摘 要】
:
目的挖掘海鞘来源放线菌Streptomyces pratensis SCSIO LCY05生产含肉桂酰独特结构单元的skyllamycins类环肽的潜能,并深入分析skyllamycins生物合成基因簇的新特征。方法利用Illumina Hiseq和Pacbio SMRT测序平台对S.pratensis SCSIO LCY05基因组DNA进行全基因组测序,通过生物信息学手段对菌株基因组的生物合成基因簇进行预测和基因功能注释,采用OSMAC(one strain many compounds)策略对S.pr
【机 构】
:
中国科学院南海海洋研究所,中国科学院大学海洋学院,南方海洋科学与工程广东省实验室(广州),广西中医药大学药学院海洋药物研究院
【基金项目】
:
国家自然科学基金项目(31870046,82022067),国家自然科学基金-山东省联合基金项目(U1706206),广东省促进经济发展专项资金(海洋经济发展用途)项目(GDME-2018C003,GDNRC[2020]070),广东省自然科学基金项目(2018A0303130005),“广东特支计划”本土创新创业团队项目(2019BT02Y262),南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队
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目的挖掘海鞘来源放线菌Streptomyces pratensis SCSIO LCY05生产含肉桂酰独特结构单元的skyllamycins类环肽的潜能,并深入分析skyllamycins生物合成基因簇的新特征。方法利用Illumina Hiseq和Pacbio SMRT测序平台对S.pratensis SCSIO LCY05基因组DNA进行全基因组测序,通过生物信息学手段对菌株基因组的生物合成基因簇进行预测和基因功能注释,采用OSMAC(one strain many compounds)策略对S.pr
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