【摘 要】
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目的通过TCGA数据库中肺鳞癌(Lung squamous cell carcinoma,LUSC)的转录组表达谱数据分析,找到与LUSC预后显著相关的转录基因,为后续研究提供数据支持。方法下载TCGA数据库
【机 构】
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西安交通大学医学部公共卫生学院,西安市健康教育所
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目的通过TCGA数据库中肺鳞癌(Lung squamous cell carcinoma,LUSC)的转录组表达谱数据分析,找到与LUSC预后显著相关的转录基因,为后续研究提供数据支持。方法下载TCGA数据库中LUSC转录组表达数据及临床数据,应用R语言进行数据合并、标准化处理及差异分析,再用SPSS 20.0软件对差异表达基因进行数据分析,筛选出与LUSC生存显著相关的特异表达转录基因。结果Spearman秩相关分析筛选出预后相关的差异基因,再经Kaplan Meier进行Log-rank检验,筛出2个
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