在QSAR中应用SVR的非线性组合预测

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为提高定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型预测的精度,以支持向量回归(support vector regression,SVR)全局与局部核函数,发展出1种非线性组合方法GK-LK-SVR,其基本思路为:依均方误差(MSE)最小原则,分别基于SVR的全局与局部核函数筛选描述符后预测,实测值与不同核函数的预测值组合成混合样本,然后再依MSE最小原则基于SVR对混合样本实施核函数寻优及子模型筛选,最后以留一法完成预测。对2种化合物QSAR建模结果表明:GK-LK-SVR方法预测精度高,有望在QSAR研究中得到广泛应用。 In order to improve the prediction precision of quantitative structure-activity relationship (QSAR) model, a nonlinear combination method, GK-LK-SVR, is developed by using global and local kernel functions of support vector regression (SVR) , The basic idea is as follows: According to the minimum mean square error (MSE) principle, the global and local kernel function descriptors based on SVR are respectively used to predict, and the measured values ​​are combined with the predicted values ​​of different kernel functions into a mixed sample, The principle is based on SVR to perform the optimization of the kernel function and the screening of the sub-model for the mixed samples. Finally, the prediction is made by leaving one method. The modeling results of two compounds QSAR show that the GK-LK-SVR method has high prediction accuracy and is expected to be widely used in QSAR research.
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