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分析2015年长春市一起发热伴出疹疫情中患者粪便肠道病毒Echovirus 18型(E-18)毒株VP1基因序列特征及其与国内外其他流行株的进化关系。
方法采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增VP1基因片段并测序,利用DNAman软件和Mega 6.0软件进行序列分析。
结果经RT-PCR方法扩增获得4株774 bp的VP1基因片段并测序,经同源性分析比较发现,各序列间核苷酸同源性为100%。与国内外E-18病毒VP1序列同源性比较发现,长春病毒株与2015年同时发现的河北省分离株同源性最高,核苷酸同源性为97%,氨基酸同源性为99%。与Metcalf原型株比较,核苷酸同源性为80%,氨基酸同源性为93%,氨基酸对比发现有18个位点发生突变。
结论吉林省首次发现E-18型肠道病毒,为中国E-18病毒分子流行病学研究提供重要信息。