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在对传统遗传算法的早熟收敛和后期收敛速度慢等问题分析的基础上，提出了一种改进的小生境遗传算法模型。该模型针对传统遗传算法的不足，采用小生境方法代替传统遗传算法的选择方式，重点改进了遗传算子，能够有效调整种群规模，延迟早熟收敛现象，控制后期收敛速度，从而能够挖掘到尽可能多的有效关联规则。最后，以中医药的疾病配方为例，验证了此算法的可行性和有效性。