目的:探讨肺泡灌洗液(BALF)的二代测序技术(NGS)在肺孢子菌肺炎中的应用价值.方法:回顾性分析南华附属长沙中心医院2017年11月～2020年11月采用肺泡灌洗液NGS技术诊断的10例孢子菌肺炎的临床特征及诊治过程,并与常规检查检验结果进行比较,分析NGS技术在肺孢子菌肺炎诊断中的应用价值.结果:10例患者中男性6例,女性4例,平均年龄(58±7)岁.3例合并AIDS,2例合并恶性肿瘤,2例合并风湿结缔组织疾病,1例合并肾病综合征,1例肾移植术后,1例合并慢阻肺,反复不规律使用激素.所有患者均有不同程度的免疫抑制.临床表现中常见症状有咳嗽(100％)、气促(80％)、咳痰(60％)、发热(40％).体征主要为肺部的干湿性啰音(80％).异常实验室检查结果有:C反应蛋白升高(88.9％);乳酸脱氢酶升高(80％);氧合指数≤300(77.8％);G实验阳性(60％);白细胞计数轻度升高(30％).症状体征及常规实验室检查均不具有特异性.所有患者均行支气管镜,肺泡灌洗液二代测序均检出肺孢子菌核酸序列.9例患者治疗后病情好转出院,1例治疗无效死亡.结论:肺泡灌洗液的二代测序诊断肺孢子菌肺炎的特异度及敏感度高,较传统方法更快速、全面、准确,可作为肺孢子菌肺炎诊断的方法之一.